Protein–RNA interactions for Protein: Q149B8

Perm1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 807 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Perm1Q149B8 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Perm1Q149B8 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Perm1Q149B8 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Perm1Q149B8 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Perm1Q149B8 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Perm1Q149B8 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Perm1Q149B8 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Perm1Q149B8 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Perm1Q149B8 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Perm1Q149B8 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Perm1Q149B8 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Perm1Q149B8 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Perm1Q149B8 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Perm1Q149B8 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Perm1Q149B8 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Perm1Q149B8 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Perm1Q149B8 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Perm1Q149B8 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Perm1Q149B8 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Perm1Q149B8 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Perm1Q149B8 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Perm1Q149B8 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Perm1Q149B8 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Perm1Q149B8 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Perm1Q149B8 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Perm1Q149B8 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Perm1Q149B8 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Perm1Q149B8 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Perm1Q149B8 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Perm1Q149B8 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Perm1Q149B8 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Perm1Q149B8 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Perm1Q149B8 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Perm1Q149B8 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Perm1Q149B8 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Perm1Q149B8 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Perm1Q149B8 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Perm1Q149B8 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Perm1Q149B8 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Perm1Q149B8 Pemt-202ENSMUST00000102692 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Perm1Q149B8 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Perm1Q149B8 Ifitm1-202ENSMUST00000106040 560 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Perm1Q149B8 Ifitm1-203ENSMUST00000106042 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Perm1Q149B8 Gm16140-201ENSMUST00000117191 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Perm1Q149B8 Gm14497-201ENSMUST00000119537 580 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Perm1Q149B8 Gm12246-201ENSMUST00000129126 503 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Perm1Q149B8 Gm13026-201ENSMUST00000140113 608 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Perm1Q149B8 Ins2-208ENSMUST00000162317 297 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Perm1Q149B8 Krtcap2-204ENSMUST00000168900 582 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Perm1Q149B8 1700017I07Rik-201ENSMUST00000184823 462 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Perm1Q149B8 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Perm1Q149B8 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Perm1Q149B8 Arhgef33-210ENSMUST00000225548 456 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Perm1Q149B8 Ifitm1-201ENSMUST00000026564 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Perm1Q149B8 Ensa-202ENSMUST00000058230 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Perm1Q149B8 Gm9791-201ENSMUST00000060997 447 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Perm1Q149B8 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Perm1Q149B8 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Perm1Q149B8 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Perm1Q149B8 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Perm1Q149B8 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Perm1Q149B8 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Perm1Q149B8 AC107453.4-201ENSMUST00000227068 1817 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Perm1Q149B8 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Perm1Q149B8 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Perm1Q149B8 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Perm1Q149B8 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Perm1Q149B8 Ccndbp1-202ENSMUST00000099488 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Perm1Q149B8 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Perm1Q149B8 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Perm1Q149B8 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Perm1Q149B8 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Perm1Q149B8 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Perm1Q149B8 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Perm1Q149B8 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Perm1Q149B8 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Perm1Q149B8 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Perm1Q149B8 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Perm1Q149B8 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Perm1Q149B8 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Perm1Q149B8 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Perm1Q149B8 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Perm1Q149B8 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Perm1Q149B8 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Perm1Q149B8 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Perm1Q149B8 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Perm1Q149B8 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Perm1Q149B8 Gm23612-201ENSMUST00000103823 110 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Perm1Q149B8 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Perm1Q149B8 Gm13204-201ENSMUST00000120110 821 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Perm1Q149B8 Gm15196-201ENSMUST00000121406 482 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Perm1Q149B8 Gm13981-201ENSMUST00000122360 447 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Perm1Q149B8 Gm15935-201ENSMUST00000141004 607 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Perm1Q149B8 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Perm1Q149B8 Gm23576-201ENSMUST00000179918 110 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Perm1Q149B8 4930578M01Rik-201ENSMUST00000180490 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Perm1Q149B8 Gm44511-201ENSMUST00000204394 678 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Perm1Q149B8 Gm44511-202ENSMUST00000204423 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Perm1Q149B8 Pet100-203ENSMUST00000207389 363 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Perm1Q149B8 Gm20735-202ENSMUST00000212387 519 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms