Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Gm14274-201ENSMUST00000117182 615 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Gm13284-201ENSMUST00000121020 547 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Rbm3os-201ENSMUST00000124018 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Gm11417-201ENSMUST00000150536 920 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Mir6923-201ENSMUST00000184592 72 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Gm44323-201ENSMUST00000198689 129 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 AC130477.1-201ENSMUST00000226982 420 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Zfp1-202ENSMUST00000211926 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Nppa-201ENSMUST00000103230 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Gm14213-201ENSMUST00000119778 768 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Spata46-201ENSMUST00000056991 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 E330011O21Rik-202ENSMUST00000209498 1403 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Gm24791-201ENSMUST00000104284 131 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Gm14398-201ENSMUST00000117287 1073 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Gm11578-201ENSMUST00000118530 459 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Gm7929-201ENSMUST00000178711 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Gm3015-202ENSMUST00000179803 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 AC158392.3-201ENSMUST00000224271 1284 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Gm5434-202ENSMUST00000222384 1451 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Gm5434-201ENSMUST00000071825 1451 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 4932431P20Rik-201ENSMUST00000098602 1340 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 1700036A12Rik-202ENSMUST00000190053 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Kyat1-202ENSMUST00000113659 1367 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Gm12663-201ENSMUST00000118481 958 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Gm21987-201ENSMUST00000119704 456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Gm5257-201ENSMUST00000121823 790 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Gm17070-201ENSMUST00000170463 784 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Gm13278-201ENSMUST00000177771 549 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Gm13275-201ENSMUST00000178347 549 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Gm13277-201ENSMUST00000178480 549 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Gm13279-201ENSMUST00000178602 549 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Gm13289-201ENSMUST00000179158 549 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Gm13276-201ENSMUST00000179372 549 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms