Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Gal3st4-201ENSMUST00000100530 3162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Sox13-203ENSMUST00000144386 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Nufip2-204ENSMUST00000181023 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Pck2-201ENSMUST00000048781 3400 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Lao1-201ENSMUST00000058651 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Hoxd1Q01822 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
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Hoxd1Q01822 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Hoxd1Q01822 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Hoxd1Q01822 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Hoxd1Q01822 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Olfr463-202ENSMUST00000215150 2031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Fsd2-201ENSMUST00000042318 3985 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Lman1-201ENSMUST00000048260 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd1Q01822 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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