Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.8 ms