Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms