Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Pnma2-201ENSMUST00000089236 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Sez6l-205ENSMUST00000212480 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Camta2-201ENSMUST00000036299 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Atp9b-201ENSMUST00000091790 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Olfr624-201ENSMUST00000062144 5731 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Tfam-201ENSMUST00000092430 4167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Acacb-202ENSMUST00000102582 8788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms