Protein–RNA interactions for Protein: P83940

Eloc, Elongin-C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ElocP83940 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ElocP83940 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
ElocP83940 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ElocP83940 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ElocP83940 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ElocP83940 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ElocP83940 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ElocP83940 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ElocP83940 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ElocP83940 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
ElocP83940 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
ElocP83940 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ElocP83940 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
ElocP83940 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ElocP83940 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ElocP83940 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ElocP83940 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ElocP83940 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ElocP83940 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ElocP83940 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ElocP83940 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ElocP83940 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
ElocP83940 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
ElocP83940 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ElocP83940 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ElocP83940 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ElocP83940 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ElocP83940 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ElocP83940 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ElocP83940 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ElocP83940 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ElocP83940 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ElocP83940 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ElocP83940 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ElocP83940 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ElocP83940 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ElocP83940 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ElocP83940 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
ElocP83940 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ElocP83940 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ElocP83940 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ElocP83940 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ElocP83940 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ElocP83940 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ElocP83940 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ElocP83940 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
ElocP83940 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ElocP83940 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ElocP83940 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
ElocP83940 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ElocP83940 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ElocP83940 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ElocP83940 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ElocP83940 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ElocP83940 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ElocP83940 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
ElocP83940 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
ElocP83940 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
ElocP83940 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ElocP83940 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
ElocP83940 Gm28836-201ENSMUST00000185842 633 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
ElocP83940 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
ElocP83940 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
ElocP83940 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
ElocP83940 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
ElocP83940 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
ElocP83940 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ElocP83940 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
ElocP83940 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
ElocP83940 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
ElocP83940 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
ElocP83940 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ElocP83940 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
ElocP83940 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
ElocP83940 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ElocP83940 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ElocP83940 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ElocP83940 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
ElocP83940 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
ElocP83940 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
ElocP83940 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
ElocP83940 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
ElocP83940 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ElocP83940 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ElocP83940 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ElocP83940 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ElocP83940 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ElocP83940 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ElocP83940 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ElocP83940 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
ElocP83940 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ElocP83940 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ElocP83940 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ElocP83940 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ElocP83940 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ElocP83940 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ElocP83940 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ElocP83940 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ElocP83940 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ElocP83940 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms