Protein–RNA interactions for Protein: P82347

Sgcd, Delta-sarcoglycan, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcdP82347 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SgcdP82347 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SgcdP82347 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SgcdP82347 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SgcdP82347 Bace2-201ENSMUST00000047275 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SgcdP82347 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SgcdP82347 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
SgcdP82347 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
SgcdP82347 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
SgcdP82347 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
SgcdP82347 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
SgcdP82347 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
SgcdP82347 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
SgcdP82347 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
SgcdP82347 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
SgcdP82347 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Duxbl1-201ENSMUST00000049793 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Olfr1495-203ENSMUST00000216980 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Nell2-202ENSMUST00000166170 3366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
SgcdP82347 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
SgcdP82347 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SgcdP82347 BC035947-201ENSMUST00000170511 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Dcun1d4-203ENSMUST00000113558 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Zcchc7-203ENSMUST00000107824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Med19-201ENSMUST00000102645 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Gm19327-201ENSMUST00000220651 3271 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SgcdP82347 4931406C07Rik-201ENSMUST00000034414 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Dzip1l-203ENSMUST00000112885 4350 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SgcdP82347 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SgcdP82347 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SgcdP82347 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SgcdP82347 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SgcdP82347 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms