Protein–RNA interactions for Protein: P80205

Otx1, Homeobox protein OTX1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx1P80205 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Otx1P80205 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Otx1P80205 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Otx1P80205 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Otx1P80205 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Otx1P80205 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Otx1P80205 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Otx1P80205 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Otx1P80205 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Otx1P80205 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Otx1P80205 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Otx1P80205 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Otx1P80205 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Otx1P80205 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Otx1P80205 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms