Protein–RNA interactions for Protein: P63072

Ubd, Ubiquitin D, mousemouse

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Length 162 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbdP63072 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
UbdP63072 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
UbdP63072 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
UbdP63072 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
UbdP63072 Ltbp1-203ENSMUST00000112516 5140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
UbdP63072 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
UbdP63072 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
UbdP63072 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
UbdP63072 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
UbdP63072 Rtl1-201ENSMUST00000149046 6358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
UbdP63072 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
UbdP63072 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
UbdP63072 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
UbdP63072 Gm5878-201ENSMUST00000113802 4643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
UbdP63072 Ptpn21-202ENSMUST00000170188 5562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
UbdP63072 Llgl1-202ENSMUST00000108719 4268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
UbdP63072 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
UbdP63072 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
UbdP63072 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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UbdP63072 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
UbdP63072 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
UbdP63072 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
UbdP63072 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
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UbdP63072 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
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UbdP63072 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
UbdP63072 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
UbdP63072 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
UbdP63072 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
UbdP63072 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
UbdP63072 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
UbdP63072 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
UbdP63072 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
UbdP63072 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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UbdP63072 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
UbdP63072 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
UbdP63072 Col4a6-201ENSMUST00000101205 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
UbdP63072 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
UbdP63072 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
UbdP63072 Mical2-202ENSMUST00000050149 6669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
UbdP63072 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
UbdP63072 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
UbdP63072 Ccnt2-201ENSMUST00000027587 6738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
UbdP63072 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
UbdP63072 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
UbdP63072 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
UbdP63072 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
UbdP63072 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
UbdP63072 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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UbdP63072 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
UbdP63072 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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UbdP63072 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
UbdP63072 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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UbdP63072 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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UbdP63072 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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UbdP63072 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
UbdP63072 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
UbdP63072 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC10□□□□□ -0.81
UbdP63072 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
UbdP63072 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC10□□□□□ -0.81
UbdP63072 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
UbdP63072 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
UbdP63072 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC10□□□□□ -0.81
UbdP63072 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC10□□□□□ -0.81
UbdP63072 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
UbdP63072 Mypn-201ENSMUST00000095580 5246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
UbdP63072 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
UbdP63072 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
UbdP63072 Myo18a-208ENSMUST00000108375 7513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
UbdP63072 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
UbdP63072 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
UbdP63072 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
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