Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Plekhg5-203ENSMUST00000105662 3933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Htr1d-203ENSMUST00000121571 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Tank-203ENSMUST00000112495 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Mmp9-201ENSMUST00000017881 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Btk-202ENSMUST00000113213 2121 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 B230323A14Rik-201ENSMUST00000180488 2864 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 8030423F21Rik-201ENSMUST00000064097 2851 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Fam228a-201ENSMUST00000111154 3004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Mdm1-201ENSMUST00000020437 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Sh3bp1P55194 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Adh6-ps1-201ENSMUST00000171054 2789 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Rasgrp4-213ENSMUST00000204845 3182 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 AC164161.2-201ENSMUST00000217446 1730 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Txnrd1-201ENSMUST00000020484 3325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Rims2-204ENSMUST00000226410 3685 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Adcy6-205ENSMUST00000228566 3707 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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