Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cdkn1bP46414 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cdkn1bP46414 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Cdkn1bP46414 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cdkn1bP46414 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cdkn1bP46414 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cdkn1bP46414 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cdkn1bP46414 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cdkn1bP46414 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cdkn1bP46414 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cdkn1bP46414 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cdkn1bP46414 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cdkn1bP46414 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Cdkn1bP46414 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cdkn1bP46414 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cdkn1bP46414 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cdkn1bP46414 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cdkn1bP46414 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cdkn1bP46414 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cdkn1bP46414 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cdkn1bP46414 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cdkn1bP46414 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cdkn1bP46414 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Cdkn1bP46414 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cdkn1bP46414 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cdkn1bP46414 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cdkn1bP46414 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cdkn1bP46414 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cdkn1bP46414 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cdkn1bP46414 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cdkn1bP46414 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cdkn1bP46414 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cdkn1bP46414 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cdkn1bP46414 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cdkn1bP46414 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cdkn1bP46414 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cdkn1bP46414 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cdkn1bP46414 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cdkn1bP46414 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cdkn1bP46414 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cdkn1bP46414 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cdkn1bP46414 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cdkn1bP46414 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cdkn1bP46414 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Cdkn1bP46414 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Cdkn1bP46414 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cdkn1bP46414 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cdkn1bP46414 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cdkn1bP46414 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cdkn1bP46414 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Cdkn1bP46414 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cdkn1bP46414 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Cdkn1bP46414 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Cdkn1bP46414 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Cdkn1bP46414 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cdkn1bP46414 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cdkn1bP46414 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Cdkn1bP46414 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cdkn1bP46414 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cdkn1bP46414 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cdkn1bP46414 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cdkn1bP46414 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cdkn1bP46414 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cdkn1bP46414 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cdkn1bP46414 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cdkn1bP46414 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cdkn1bP46414 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cdkn1bP46414 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cdkn1bP46414 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cdkn1bP46414 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cdkn1bP46414 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cdkn1bP46414 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cdkn1bP46414 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cdkn1bP46414 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cdkn1bP46414 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cdkn1bP46414 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cdkn1bP46414 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cdkn1bP46414 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cdkn1bP46414 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cdkn1bP46414 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cdkn1bP46414 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cdkn1bP46414 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cdkn1bP46414 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cdkn1bP46414 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cdkn1bP46414 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cdkn1bP46414 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cdkn1bP46414 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cdkn1bP46414 Zfp957-201ENSMUST00000040802 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cdkn1bP46414 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cdkn1bP46414 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cdkn1bP46414 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cdkn1bP46414 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cdkn1bP46414 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cdkn1bP46414 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cdkn1bP46414 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cdkn1bP46414 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cdkn1bP46414 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cdkn1bP46414 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cdkn1bP46414 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cdkn1bP46414 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms