Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Arpp21-217ENSMUST00000161412 1687 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Invs-201ENSMUST00000030029 5633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Car12-202ENSMUST00000085420 3639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 4732490B19Rik-201ENSMUST00000130373 2446 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Hcrtr2-203ENSMUST00000184757 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 C4b-201ENSMUST00000069507 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Gm35507-201ENSMUST00000197932 2761 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Vwa5b2-202ENSMUST00000096197 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Pck2-201ENSMUST00000048781 3400 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Zfp617-201ENSMUST00000119003 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Gm6559-201ENSMUST00000204678 1694 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Fam198b-202ENSMUST00000118853 6729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Chd7-206ENSMUST00000170391 3462 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Spata31d1a-203ENSMUST00000224982 5325 ntAPPRIS P1 BASIC7.77□□□□□ -1.17
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