Protein–RNA interactions for Protein: P38575

Upk2, Uroplakin-2, mousemouse

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Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk2P38575 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Upk2P38575 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Upk2P38575 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Upk2P38575 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Upk2P38575 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Upk2P38575 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Upk2P38575 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Upk2P38575 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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