Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

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Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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