Protein–RNA interactions for Protein: P29788

Vtn, Vitronectin, mousemouse

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VtnP29788 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
VtnP29788 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
VtnP29788 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
VtnP29788 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
VtnP29788 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
VtnP29788 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
VtnP29788 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
VtnP29788 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
VtnP29788 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
VtnP29788 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
VtnP29788 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
VtnP29788 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
VtnP29788 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
VtnP29788 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
VtnP29788 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
VtnP29788 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
VtnP29788 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
VtnP29788 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
VtnP29788 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
VtnP29788 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
VtnP29788 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
VtnP29788 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
VtnP29788 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
VtnP29788 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
VtnP29788 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
VtnP29788 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
VtnP29788 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
VtnP29788 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
VtnP29788 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
VtnP29788 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
VtnP29788 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
VtnP29788 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
VtnP29788 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
VtnP29788 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
VtnP29788 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
VtnP29788 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
VtnP29788 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
VtnP29788 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
VtnP29788 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
VtnP29788 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
VtnP29788 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
VtnP29788 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
VtnP29788 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
VtnP29788 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
VtnP29788 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
VtnP29788 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
VtnP29788 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
VtnP29788 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
VtnP29788 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
VtnP29788 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
VtnP29788 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
VtnP29788 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
VtnP29788 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
VtnP29788 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
VtnP29788 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
VtnP29788 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
VtnP29788 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
VtnP29788 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
VtnP29788 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
VtnP29788 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
VtnP29788 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
VtnP29788 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
VtnP29788 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
VtnP29788 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
VtnP29788 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
VtnP29788 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
VtnP29788 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
VtnP29788 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
VtnP29788 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
VtnP29788 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
VtnP29788 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
VtnP29788 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
VtnP29788 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
VtnP29788 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
VtnP29788 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
VtnP29788 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
VtnP29788 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
VtnP29788 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
VtnP29788 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
VtnP29788 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
VtnP29788 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
VtnP29788 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
VtnP29788 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
VtnP29788 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
VtnP29788 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
VtnP29788 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
VtnP29788 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
VtnP29788 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
VtnP29788 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
VtnP29788 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
VtnP29788 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
VtnP29788 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
VtnP29788 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
VtnP29788 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
VtnP29788 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
VtnP29788 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
VtnP29788 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
VtnP29788 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
VtnP29788 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
VtnP29788 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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