Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
RxrgP28705 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RxrgP28705 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RxrgP28705 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RxrgP28705 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RxrgP28705 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RxrgP28705 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
RxrgP28705 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RxrgP28705 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RxrgP28705 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RxrgP28705 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
RxrgP28705 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RxrgP28705 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms