Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
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