Protein–RNA interactions for Protein: P27661

H2afx, Histone H2AX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 143 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afxP27661 Tfam-201ENSMUST00000092430 4167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
H2afxP27661 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
H2afxP27661 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
H2afxP27661 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
H2afxP27661 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
H2afxP27661 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC12□□□□□ -0.49
H2afxP27661 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC12□□□□□ -0.49
H2afxP27661 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
H2afxP27661 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
H2afxP27661 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
H2afxP27661 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
H2afxP27661 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
H2afxP27661 Arhgap36-202ENSMUST00000114904 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
H2afxP27661 BC035947-201ENSMUST00000170511 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
H2afxP27661 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC12□□□□□ -0.49
H2afxP27661 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
H2afxP27661 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
H2afxP27661 Polr3c-201ENSMUST00000029741 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
H2afxP27661 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
H2afxP27661 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
H2afxP27661 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
H2afxP27661 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
H2afxP27661 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
H2afxP27661 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
H2afxP27661 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
H2afxP27661 Tubb5-201ENSMUST00000001566 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
H2afxP27661 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
H2afxP27661 Gm33366-201ENSMUST00000195583 3827 ntBASIC12□□□□□ -0.49
H2afxP27661 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
H2afxP27661 Gk2-201ENSMUST00000059657 1880 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
H2afxP27661 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
H2afxP27661 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
H2afxP27661 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
H2afxP27661 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
H2afxP27661 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
H2afxP27661 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
H2afxP27661 Aplp2-202ENSMUST00000079758 3504 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
H2afxP27661 Gm15943-201ENSMUST00000147638 3821 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
H2afxP27661 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
H2afxP27661 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
H2afxP27661 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
H2afxP27661 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
H2afxP27661 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
H2afxP27661 Gm27177-201ENSMUST00000183339 2946 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
H2afxP27661 Pcdhb9-201ENSMUST00000057228 3055 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
H2afxP27661 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
H2afxP27661 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
H2afxP27661 Slx1b-203ENSMUST00000144897 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
H2afxP27661 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
H2afxP27661 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
H2afxP27661 2410004P03Rik-201ENSMUST00000095823 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
H2afxP27661 Sun1-205ENSMUST00000110883 3714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
H2afxP27661 Gm23061-201ENSMUST00000102348 116 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
H2afxP27661 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
H2afxP27661 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
H2afxP27661 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
H2afxP27661 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
H2afxP27661 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
H2afxP27661 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
H2afxP27661 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
H2afxP27661 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
H2afxP27661 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
H2afxP27661 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
H2afxP27661 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
H2afxP27661 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
H2afxP27661 AC137950.2-201ENSMUST00000227127 1089 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
H2afxP27661 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
H2afxP27661 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
H2afxP27661 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
H2afxP27661 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
H2afxP27661 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
H2afxP27661 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
H2afxP27661 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
H2afxP27661 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
H2afxP27661 Serpina3g-201ENSMUST00000043315 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
H2afxP27661 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
H2afxP27661 N4bp2l1-205ENSMUST00000202031 1864 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
H2afxP27661 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
H2afxP27661 Tor4a-201ENSMUST00000081869 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
H2afxP27661 Copb1-201ENSMUST00000033012 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
H2afxP27661 Grik4-201ENSMUST00000034515 3413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
H2afxP27661 C230021G24Rik-201ENSMUST00000181196 3679 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
H2afxP27661 Thbd-201ENSMUST00000099270 3723 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
H2afxP27661 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
H2afxP27661 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
H2afxP27661 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
H2afxP27661 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
H2afxP27661 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
H2afxP27661 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
H2afxP27661 Gm26822-201ENSMUST00000181732 3374 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
H2afxP27661 Ywhaz-201ENSMUST00000022894 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
H2afxP27661 6430548M08Rik-203ENSMUST00000108950 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
H2afxP27661 Gm26625-201ENSMUST00000181519 2538 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
H2afxP27661 Galm-201ENSMUST00000039205 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
H2afxP27661 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
H2afxP27661 Spata16-201ENSMUST00000047005 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
H2afxP27661 Xlr4c-201ENSMUST00000068551 1500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
H2afxP27661 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
H2afxP27661 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
H2afxP27661 Serac1-202ENSMUST00000097432 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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