Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
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Ggta1P23336 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
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Ggta1P23336 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 Smg6-201ENSMUST00000045281 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ggta1P23336 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ggta1P23336 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
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Ggta1P23336 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ggta1P23336 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ggta1P23336 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ggta1P23336 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ggta1P23336 Cacna1c-224ENSMUST00000219018 7516 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ggta1P23336 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ggta1P23336 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
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Ggta1P23336 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ggta1P23336 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
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Ggta1P23336 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ggta1P23336 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ggta1P23336 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
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Ggta1P23336 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ggta1P23336 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ggta1P23336 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ggta1P23336 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ggta1P23336 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ggta1P23336 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ggta1P23336 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ggta1P23336 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ggta1P23336 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Ggta1P23336 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ggta1P23336 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ggta1P23336 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ggta1P23336 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ggta1P23336 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ggta1P23336 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ggta1P23336 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ggta1P23336 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ggta1P23336 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ggta1P23336 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ggta1P23336 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ggta1P23336 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ggta1P23336 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
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Ggta1P23336 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
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Ggta1P23336 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
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