Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Olfr1490-202ENSMUST00000213900 5165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
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