Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Zcchc7-203ENSMUST00000107824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Gm37744-201ENSMUST00000194616 1590 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Tacc2-205ENSMUST00000207282 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Ccdc33-201ENSMUST00000042205 2632 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Gm12333-201ENSMUST00000155508 2669 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Gm30648-202ENSMUST00000200648 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Il33-202ENSMUST00000120388 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms