Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Sorbs3-201ENSMUST00000022682 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Arhgap15os-201ENSMUST00000139948 1761 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Nell2-202ENSMUST00000166170 3366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Armcx2-202ENSMUST00000113193 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Mir670hg-205ENSMUST00000210851 1148 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 AC154248.2-201ENSMUST00000221964 659 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Gm19327-201ENSMUST00000220651 3271 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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