Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PcnaP17918 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PcnaP17918 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PcnaP17918 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PcnaP17918 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PcnaP17918 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PcnaP17918 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
PcnaP17918 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PcnaP17918 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms