Protein–RNA interactions for Protein: P17533

Defa-rs1, Alpha-defensin-related sequence 1, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs1P17533 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Ighv1-74-201ENSMUST00000103543 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Gm23745-201ENSMUST00000104230 125 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Gm23132-201ENSMUST00000104254 132 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Cdk1-202ENSMUST00000119827 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Gm12961-201ENSMUST00000120507 1050 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 H2afb3-201ENSMUST00000122050 348 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Snhg3-202ENSMUST00000141090 581 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Gm16275-201ENSMUST00000147774 712 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Gm25394-201ENSMUST00000157338 133 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Gm25830-201ENSMUST00000158923 132 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 4930524O07Rik-202ENSMUST00000162334 293 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Gm17066-202ENSMUST00000165350 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 AC162938.2-202ENSMUST00000215497 722 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Lsm3-201ENSMUST00000040607 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Smco1-201ENSMUST00000093183 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Gm26818-201ENSMUST00000181367 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Gm23612-201ENSMUST00000103823 110 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Pex5l-203ENSMUST00000108221 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Gm12418-201ENSMUST00000118116 942 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Ube2d-ps-201ENSMUST00000121354 441 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Gm15196-201ENSMUST00000121406 482 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Gm15498-201ENSMUST00000126693 723 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Gm13026-201ENSMUST00000140113 608 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Hsd11b1-203ENSMUST00000160929 1256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Gm17606-201ENSMUST00000169818 234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Ppy-202ENSMUST00000170554 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Gm23576-201ENSMUST00000179918 110 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 4930578M01Rik-201ENSMUST00000180490 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Gm37452-201ENSMUST00000194416 1160 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
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