Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Tnip1-205ENSMUST00000108886 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Adra1a-202ENSMUST00000159068 4282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Kcnj9-201ENSMUST00000062387 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Plec-206ENSMUST00000074834 14855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Adam22-202ENSMUST00000050166 8969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Gm19327-201ENSMUST00000220651 3271 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Ighmbp2-201ENSMUST00000025751 3720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Jarid2-208ENSMUST00000173246 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Dhx34-204ENSMUST00000121123 3880 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Ank3-204ENSMUST00000092432 5832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Disp1-201ENSMUST00000003035 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Flna-202ENSMUST00000101454 8345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Agbl2-201ENSMUST00000037206 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Fam83c-201ENSMUST00000029143 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Olfr624-201ENSMUST00000062144 5731 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Ccdc116-202ENSMUST00000115709 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Nlgn3-201ENSMUST00000065858 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Nrp2-206ENSMUST00000114157 6357 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Kir3dl2-201ENSMUST00000072125 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Plcxd2-201ENSMUST00000130481 7140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Tnfsf13b-203ENSMUST00000207792 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Specc1l-201ENSMUST00000040105 5928 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Dzip1l-203ENSMUST00000112885 4350 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Svil-204ENSMUST00000127297 6243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Gm12799-201ENSMUST00000118151 2560 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Gpatch2-202ENSMUST00000065573 4547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Zfp804b-202ENSMUST00000200317 4430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Olfr222-202ENSMUST00000214351 2474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Pax6-225ENSMUST00000167211 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Ccdc136-208ENSMUST00000180829 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Umodl1-203ENSMUST00000114555 5041 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Apbb1-217ENSMUST00000191011 2712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Gm10614-201ENSMUST00000181414 2538 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Src-205ENSMUST00000109533 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Unkl-202ENSMUST00000039734 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms