Protein–RNA interactions for Protein: P12813

Nr4a1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a1P12813 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nr4a1P12813 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nr4a1P12813 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nr4a1P12813 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nr4a1P12813 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nr4a1P12813 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Nr4a1P12813 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nr4a1P12813 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nr4a1P12813 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nr4a1P12813 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nr4a1P12813 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nr4a1P12813 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Nr4a1P12813 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nr4a1P12813 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nr4a1P12813 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nr4a1P12813 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nr4a1P12813 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nr4a1P12813 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nr4a1P12813 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nr4a1P12813 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nr4a1P12813 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nr4a1P12813 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nr4a1P12813 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nr4a1P12813 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nr4a1P12813 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nr4a1P12813 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nr4a1P12813 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nr4a1P12813 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Nr4a1P12813 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nr4a1P12813 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nr4a1P12813 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Nr4a1P12813 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nr4a1P12813 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nr4a1P12813 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nr4a1P12813 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nr4a1P12813 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nr4a1P12813 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nr4a1P12813 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nr4a1P12813 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nr4a1P12813 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nr4a1P12813 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nr4a1P12813 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nr4a1P12813 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nr4a1P12813 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nr4a1P12813 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Nr4a1P12813 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nr4a1P12813 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nr4a1P12813 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nr4a1P12813 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nr4a1P12813 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nr4a1P12813 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nr4a1P12813 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nr4a1P12813 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nr4a1P12813 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nr4a1P12813 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nr4a1P12813 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nr4a1P12813 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nr4a1P12813 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nr4a1P12813 C2cd5-204ENSMUST00000203187 3494 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nr4a1P12813 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nr4a1P12813 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nr4a1P12813 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nr4a1P12813 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nr4a1P12813 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Nr4a1P12813 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Nr4a1P12813 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Nr4a1P12813 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Nr4a1P12813 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Nr4a1P12813 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Nr4a1P12813 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Nr4a1P12813 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Nr4a1P12813 Usp44-202ENSMUST00000216224 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Nr4a1P12813 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Nr4a1P12813 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Nr4a1P12813 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Nr4a1P12813 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Nr4a1P12813 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Nr4a1P12813 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Nr4a1P12813 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Nr4a1P12813 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Nr4a1P12813 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Nr4a1P12813 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Nr4a1P12813 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Nr4a1P12813 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Nr4a1P12813 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Nr4a1P12813 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Nr4a1P12813 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Nr4a1P12813 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Nr4a1P12813 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Nr4a1P12813 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Nr4a1P12813 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Nr4a1P12813 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Nr4a1P12813 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Nr4a1P12813 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Nr4a1P12813 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Nr4a1P12813 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Nr4a1P12813 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Nr4a1P12813 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Nr4a1P12813 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Nr4a1P12813 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms