Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Nrg1-212ENSMUST00000208598 1778 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Tmem88b-201ENSMUST00000097742 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 4930512J16Rik-201ENSMUST00000203704 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Ablim2-204ENSMUST00000114204 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Oxsm-201ENSMUST00000022311 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Sh3bgrl2-203ENSMUST00000188030 2549 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Gm21039-201ENSMUST00000223359 2012 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Slc6a9-202ENSMUST00000063857 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Pde6c-202ENSMUST00000112329 2895 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Lsamp-201ENSMUST00000078873 2951 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Slfn1-201ENSMUST00000037994 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Agpat3-204ENSMUST00000105389 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Pde1b-205ENSMUST00000227955 3258 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Slc7a3-203ENSMUST00000113710 2750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Lrpap1-201ENSMUST00000030986 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Tmem126b-201ENSMUST00000032843 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Rnf2-201ENSMUST00000076110 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Srrm4-202ENSMUST00000139425 2798 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Ints6l-201ENSMUST00000039374 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
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