Protein–RNA interactions for Protein: P01852

T-cell receptor beta-1 chain C region, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01852 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01852 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
P01852 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01852 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01852 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01852 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01852 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
P01852 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01852 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01852 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01852 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01852 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01852 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01852 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
P01852 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01852 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01852 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01852 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01852 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01852 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01852 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01852 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01852 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01852 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01852 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01852 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01852 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01852 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01852 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01852 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01852 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01852 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01852 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01852 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P01852 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01852 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01852 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01852 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01852 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01852 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01852 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01852 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01852 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01852 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01852 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01852 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01852 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01852 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01852 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01852 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P01852 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P01852 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01852 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01852 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01852 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01852 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P01852 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01852 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P01852 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P01852 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01852 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P01852 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P01852 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01852 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01852 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01852 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01852 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01852 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P01852 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01852 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P01852 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01852 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01852 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01852 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01852 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01852 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01852 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01852 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01852 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01852 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01852 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01852 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01852 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01852 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01852 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01852 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01852 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01852 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01852 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01852 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01852 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01852 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01852 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01852 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01852 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01852 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01852 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01852 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01852 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01852 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms