Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Ccl20O89093 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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