Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Gm11619-201ENSMUST00000117474 237 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Gm7541-201ENSMUST00000118361 535 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Gm6322-201ENSMUST00000118789 1004 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Gm11979-201ENSMUST00000119629 743 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Gm14213-201ENSMUST00000119778 768 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Gm13445-201ENSMUST00000121664 307 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Gm11354-201ENSMUST00000121974 422 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Rbm3os-201ENSMUST00000124018 839 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Gm13530-201ENSMUST00000134014 390 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Gm13558-201ENSMUST00000140464 554 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 1700123M08Rik-202ENSMUST00000146154 770 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 1810021B22Rik-201ENSMUST00000150364 652 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Gas5-224ENSMUST00000162558 502 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Anapc16-203ENSMUST00000182152 847 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 E230034D01Rik-201ENSMUST00000214440 1212 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Gm18499-201ENSMUST00000220808 1021 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Aimp1-201ENSMUST00000029663 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Ccdc90b-202ENSMUST00000085017 1494 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Gm14274-201ENSMUST00000117182 615 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Gm12943-201ENSMUST00000119616 210 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Gm14993-201ENSMUST00000121180 164 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Gm11884-201ENSMUST00000131639 641 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Gm16030-201ENSMUST00000159098 603 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Gm26555-201ENSMUST00000180452 1037 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Gm7719-201ENSMUST00000182374 975 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 C230057A21Rik-202ENSMUST00000195781 600 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Gm5870-201ENSMUST00000196461 282 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 AC112146.1-201ENSMUST00000221641 733 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Cxcl1-201ENSMUST00000031327 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
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