Protein–RNA interactions for Protein: O35451

Atf6b, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 beta, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6bO35451 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Atf6bO35451 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Atf6bO35451 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Atf6bO35451 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Atf6bO35451 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Atf6bO35451 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Egfr-201ENSMUST00000020329 10208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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