Protein–RNA interactions for Protein: O35367

Kera, Keratocan, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KeraO35367 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
KeraO35367 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
KeraO35367 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
KeraO35367 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
KeraO35367 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
KeraO35367 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
KeraO35367 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
KeraO35367 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
KeraO35367 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
KeraO35367 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
KeraO35367 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
KeraO35367 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
KeraO35367 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
KeraO35367 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
KeraO35367 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
KeraO35367 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
KeraO35367 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
KeraO35367 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
KeraO35367 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
KeraO35367 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
KeraO35367 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
KeraO35367 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
KeraO35367 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
KeraO35367 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
KeraO35367 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
KeraO35367 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
KeraO35367 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
KeraO35367 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
KeraO35367 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
KeraO35367 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
KeraO35367 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
KeraO35367 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
KeraO35367 Adcy8-202ENSMUST00000228014 6900 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
KeraO35367 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
KeraO35367 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
KeraO35367 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
KeraO35367 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
KeraO35367 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
KeraO35367 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
KeraO35367 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
KeraO35367 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
KeraO35367 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
KeraO35367 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
KeraO35367 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
KeraO35367 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
KeraO35367 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
KeraO35367 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
KeraO35367 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
KeraO35367 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
KeraO35367 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
KeraO35367 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
KeraO35367 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
KeraO35367 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
KeraO35367 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
KeraO35367 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
KeraO35367 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
KeraO35367 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
KeraO35367 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
KeraO35367 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
KeraO35367 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
KeraO35367 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
KeraO35367 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
KeraO35367 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
KeraO35367 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
KeraO35367 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
KeraO35367 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
KeraO35367 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
KeraO35367 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
KeraO35367 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
KeraO35367 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
KeraO35367 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
KeraO35367 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
KeraO35367 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
KeraO35367 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
KeraO35367 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
KeraO35367 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
KeraO35367 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
KeraO35367 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
KeraO35367 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
KeraO35367 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
KeraO35367 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
KeraO35367 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
KeraO35367 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
KeraO35367 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
KeraO35367 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
KeraO35367 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
KeraO35367 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
KeraO35367 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
KeraO35367 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
KeraO35367 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
KeraO35367 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
KeraO35367 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
KeraO35367 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
KeraO35367 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
KeraO35367 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
KeraO35367 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
KeraO35367 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
KeraO35367 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
KeraO35367 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
KeraO35367 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73 ms