Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 C130060K24Rik-203ENSMUST00000170608 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Fan1-201ENSMUST00000163289 3460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Ap4m1-201ENSMUST00000019662 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Gm35021-201ENSMUST00000210105 2329 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Gm6559-201ENSMUST00000204678 1694 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Ap1b1-201ENSMUST00000009234 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Bcl7a-202ENSMUST00000117971 4642 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 P2ry1-202ENSMUST00000193201 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Abhd4-201ENSMUST00000041197 2401 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 1810053B23Rik-205ENSMUST00000188056 1592 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Vmn1r58G3X9U3 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Gtf2ird1-204ENSMUST00000100652 3693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Il10ra-202ENSMUST00000176222 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Tmprss2-201ENSMUST00000000395 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Rpe65-202ENSMUST00000196999 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Olfr1113-202ENSMUST00000215611 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Cfb-207ENSMUST00000176203 2733 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Mkks-202ENSMUST00000110089 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 AC164092.1-201ENSMUST00000215635 2232 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Slco5a1-201ENSMUST00000115402 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Anxa7-201ENSMUST00000065504 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Apba2-201ENSMUST00000032732 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Gm10699-201ENSMUST00000098916 2130 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Mkx-201ENSMUST00000079788 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 BC049352-203ENSMUST00000171799 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Crebrf-203ENSMUST00000142539 2674 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vmn1r58G3X9U3 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.9 ms