Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ70

Scaper, S phase cyclin A-associated protein in the ER, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,398 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScaperF8VQ70 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Tex29-205ENSMUST00000209692 884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Stt3a-209ENSMUST00000217599 285 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 1700125H20Rik-202ENSMUST00000100681 687 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Surf6-202ENSMUST00000114043 894 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Znrd1-202ENSMUST00000172518 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 E030018B13Rik-201ENSMUST00000177638 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Gm28529-201ENSMUST00000186159 387 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Pcgf5-204ENSMUST00000224772 1266 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Gm13558-201ENSMUST00000140464 554 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Smim20-201ENSMUST00000147148 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 2700099C18Rik-202ENSMUST00000182402 1275 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Gm43752-201ENSMUST00000198475 697 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Gm18968-201ENSMUST00000221319 862 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Sept4-202ENSMUST00000063156 1245 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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