Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-M1F7CXU4 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-M1F7CXU4 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-M1F7CXU4 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-M1F7CXU4 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-M1F7CXU4 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-M1F7CXU4 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-M1F7CXU4 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-M1F7CXU4 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-M1F7CXU4 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-M1F7CXU4 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-M1F7CXU4 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-M1F7CXU4 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-M1F7CXU4 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-M1F7CXU4 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-M1F7CXU4 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-M1F7CXU4 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-M1F7CXU4 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-M1F7CXU4 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-M1F7CXU4 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-M1F7CXU4 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-M1F7CXU4 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-M1F7CXU4 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-M1F7CXU4 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-M1F7CXU4 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-M1F7CXU4 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-M1F7CXU4 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-M1F7CXU4 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-M1F7CXU4 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-M1F7CXU4 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-M1F7CXU4 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-M1F7CXU4 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-M1F7CXU4 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-M1F7CXU4 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-M1F7CXU4 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-M1F7CXU4 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-M1F7CXU4 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-M1F7CXU4 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-M1F7CXU4 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-M1F7CXU4 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-M1F7CXU4 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-M1F7CXU4 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-M1F7CXU4 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-M1F7CXU4 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-M1F7CXU4 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
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H2-M1F7CXU4 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-M1F7CXU4 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
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H2-M1F7CXU4 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
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H2-M1F7CXU4 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-M1F7CXU4 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-M1F7CXU4 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-M1F7CXU4 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-M1F7CXU4 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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H2-M1F7CXU4 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-M1F7CXU4 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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H2-M1F7CXU4 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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H2-M1F7CXU4 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-M1F7CXU4 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-M1F7CXU4 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-M1F7CXU4 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-M1F7CXU4 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-M1F7CXU4 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-M1F7CXU4 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-M1F7CXU4 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-M1F7CXU4 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-M1F7CXU4 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-M1F7CXU4 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-M1F7CXU4 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-M1F7CXU4 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M1F7CXU4 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M1F7CXU4 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M1F7CXU4 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M1F7CXU4 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M1F7CXU4 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M1F7CXU4 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M1F7CXU4 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M1F7CXU4 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M1F7CXU4 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M1F7CXU4 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M1F7CXU4 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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H2-M1F7CXU4 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M1F7CXU4 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M1F7CXU4 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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