Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Fcer2a-206ENSMUST00000208438 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Fcer2a-208ENSMUST00000208603 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Park2-210ENSMUST00000218435 865 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Gm18499-201ENSMUST00000220808 1021 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Gpcpd1-202ENSMUST00000060955 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Gm43334-201ENSMUST00000197740 1318 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 1500004A13Rik-209ENSMUST00000185189 1659 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Atp6v1g2-202ENSMUST00000118384 483 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Gm3828-201ENSMUST00000121817 257 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Spaca9-202ENSMUST00000124840 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Prdx2-208ENSMUST00000164807 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Gm37852-201ENSMUST00000193027 350 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Bcap31-201ENSMUST00000002091 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 4930543N07Rik-202ENSMUST00000209503 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Gm45613-201ENSMUST00000210718 443 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 AI463170-202ENSMUST00000218453 558 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Tspo2-201ENSMUST00000024794 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Ctxn2-201ENSMUST00000099452 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Zfp961-203ENSMUST00000132848 781 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Fxyd5-209ENSMUST00000162087 762 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Gas5-224ENSMUST00000162558 502 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Gm28529-201ENSMUST00000186159 387 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
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PtprbB2RU80 Gm31513-201ENSMUST00000223261 684 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
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PtprbB2RU80 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Fam3a-204ENSMUST00000114141 1243 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Gm12389-201ENSMUST00000117696 418 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Gm12663-201ENSMUST00000118481 958 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Gm12069-201ENSMUST00000145127 806 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Gm20471-201ENSMUST00000172793 626 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Gm26272-201ENSMUST00000179241 132 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Isoc2b-205ENSMUST00000208816 820 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Gm19640-201ENSMUST00000214849 464 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 AC170597.1-201ENSMUST00000221956 440 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Gm26670-202ENSMUST00000226862 340 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Cxcl1-201ENSMUST00000031327 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
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