Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Myh13-201ENSMUST00000081911 5817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Tiam2-201ENSMUST00000072156 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Scn9a-201ENSMUST00000100063 9813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Scn9a-202ENSMUST00000100064 9840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Sez6l-202ENSMUST00000079491 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Nup210-202ENSMUST00000113509 6893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Rtn3-204ENSMUST00000088171 4973 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Dlec1-208ENSMUST00000165231 5263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Phf8-211ENSMUST00000168501 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms