Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pgap2-201ENSMUST00000033292 1201 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Krtap4-13-201ENSMUST00000050106 815 ntAPPRIS P1 BASIC6.79□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 2310057N15Rik-201ENSMUST00000054223 1028 ntAPPRIS P1 BASIC6.79□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Actg1-201ENSMUST00000062147 876 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC6.79□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC6.78□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC6.78□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Opn1mw-202ENSMUST00000101457 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.78□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11502-201ENSMUST00000120917 1211 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fxyd5-209ENSMUST00000162087 762 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gas5-224ENSMUST00000162558 502 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm17192-201ENSMUST00000169031 511 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nudt12-203ENSMUST00000174122 1244 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm9507-202ENSMUST00000180157 654 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43912-201ENSMUST00000204352 538 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tex29-205ENSMUST00000209692 884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Retnla-201ENSMUST00000023329 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 C8g-202ENSMUST00000040042 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC6.78□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sept4-202ENSMUST00000063156 1245 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr314-201ENSMUST00000076393 1131 ntAPPRIS P1 BASIC6.78□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 n-R5s185-201ENSMUST00000083953 119 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC6.78□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lta-201ENSMUST00000025266 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
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