Protein–RNA interactions for Protein: W8DXL4

Lrit3, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 681 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit3W8DXL4 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrit3W8DXL4 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrit3W8DXL4 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrit3W8DXL4 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrit3W8DXL4 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrit3W8DXL4 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrit3W8DXL4 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrit3W8DXL4 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrit3W8DXL4 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrit3W8DXL4 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrit3W8DXL4 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrit3W8DXL4 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrit3W8DXL4 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrit3W8DXL4 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrit3W8DXL4 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrit3W8DXL4 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrit3W8DXL4 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrit3W8DXL4 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrit3W8DXL4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrit3W8DXL4 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrit3W8DXL4 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrit3W8DXL4 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrit3W8DXL4 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrit3W8DXL4 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrit3W8DXL4 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrit3W8DXL4 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrit3W8DXL4 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrit3W8DXL4 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrit3W8DXL4 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrit3W8DXL4 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrit3W8DXL4 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrit3W8DXL4 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrit3W8DXL4 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrit3W8DXL4 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrit3W8DXL4 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrit3W8DXL4 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrit3W8DXL4 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrit3W8DXL4 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrit3W8DXL4 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrit3W8DXL4 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrit3W8DXL4 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrit3W8DXL4 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrit3W8DXL4 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrit3W8DXL4 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrit3W8DXL4 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrit3W8DXL4 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrit3W8DXL4 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrit3W8DXL4 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrit3W8DXL4 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrit3W8DXL4 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrit3W8DXL4 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrit3W8DXL4 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrit3W8DXL4 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrit3W8DXL4 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrit3W8DXL4 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrit3W8DXL4 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrit3W8DXL4 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrit3W8DXL4 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Lrit3W8DXL4 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lrit3W8DXL4 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lrit3W8DXL4 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Lrit3W8DXL4 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lrit3W8DXL4 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lrit3W8DXL4 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrit3W8DXL4 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrit3W8DXL4 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrit3W8DXL4 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrit3W8DXL4 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrit3W8DXL4 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrit3W8DXL4 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrit3W8DXL4 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lrit3W8DXL4 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lrit3W8DXL4 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lrit3W8DXL4 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lrit3W8DXL4 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lrit3W8DXL4 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lrit3W8DXL4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lrit3W8DXL4 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lrit3W8DXL4 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lrit3W8DXL4 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lrit3W8DXL4 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lrit3W8DXL4 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lrit3W8DXL4 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lrit3W8DXL4 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lrit3W8DXL4 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lrit3W8DXL4 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lrit3W8DXL4 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lrit3W8DXL4 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lrit3W8DXL4 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Lrit3W8DXL4 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lrit3W8DXL4 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lrit3W8DXL4 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lrit3W8DXL4 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lrit3W8DXL4 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lrit3W8DXL4 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lrit3W8DXL4 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lrit3W8DXL4 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lrit3W8DXL4 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lrit3W8DXL4 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Lrit3W8DXL4 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms