Protein–RNA interactions for Protein: S4R2K0

Pdf, Peptide deformylase, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdfS4R2K0 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PdfS4R2K0 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PdfS4R2K0 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PdfS4R2K0 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PdfS4R2K0 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PdfS4R2K0 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PdfS4R2K0 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PdfS4R2K0 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PdfS4R2K0 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PdfS4R2K0 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PdfS4R2K0 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PdfS4R2K0 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PdfS4R2K0 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PdfS4R2K0 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PdfS4R2K0 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PdfS4R2K0 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PdfS4R2K0 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PdfS4R2K0 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PdfS4R2K0 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PdfS4R2K0 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PdfS4R2K0 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PdfS4R2K0 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PdfS4R2K0 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PdfS4R2K0 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PdfS4R2K0 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PdfS4R2K0 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PdfS4R2K0 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PdfS4R2K0 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PdfS4R2K0 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PdfS4R2K0 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PdfS4R2K0 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PdfS4R2K0 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PdfS4R2K0 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PdfS4R2K0 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PdfS4R2K0 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PdfS4R2K0 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PdfS4R2K0 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PdfS4R2K0 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PdfS4R2K0 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PdfS4R2K0 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PdfS4R2K0 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PdfS4R2K0 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PdfS4R2K0 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PdfS4R2K0 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PdfS4R2K0 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PdfS4R2K0 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PdfS4R2K0 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PdfS4R2K0 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PdfS4R2K0 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PdfS4R2K0 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PdfS4R2K0 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PdfS4R2K0 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PdfS4R2K0 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PdfS4R2K0 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PdfS4R2K0 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PdfS4R2K0 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PdfS4R2K0 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PdfS4R2K0 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PdfS4R2K0 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PdfS4R2K0 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PdfS4R2K0 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PdfS4R2K0 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PdfS4R2K0 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PdfS4R2K0 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PdfS4R2K0 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PdfS4R2K0 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PdfS4R2K0 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PdfS4R2K0 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PdfS4R2K0 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PdfS4R2K0 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PdfS4R2K0 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PdfS4R2K0 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdfS4R2K0 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdfS4R2K0 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdfS4R2K0 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdfS4R2K0 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdfS4R2K0 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdfS4R2K0 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdfS4R2K0 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdfS4R2K0 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdfS4R2K0 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdfS4R2K0 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PdfS4R2K0 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PdfS4R2K0 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PdfS4R2K0 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PdfS4R2K0 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PdfS4R2K0 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PdfS4R2K0 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PdfS4R2K0 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PdfS4R2K0 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PdfS4R2K0 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PdfS4R2K0 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PdfS4R2K0 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PdfS4R2K0 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PdfS4R2K0 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PdfS4R2K0 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PdfS4R2K0 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PdfS4R2K0 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PdfS4R2K0 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PdfS4R2K0 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms