Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Y3

Homer1, Homer protein homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer1Q9Z2Y3 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Homer1Q9Z2Y3 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Homer1Q9Z2Y3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Homer1Q9Z2Y3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Homer1Q9Z2Y3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Homer1Q9Z2Y3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Homer1Q9Z2Y3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Homer1Q9Z2Y3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Homer1Q9Z2Y3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Homer1Q9Z2Y3 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Homer1Q9Z2Y3 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Homer1Q9Z2Y3 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Homer1Q9Z2Y3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Homer1Q9Z2Y3 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Homer1Q9Z2Y3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Homer1Q9Z2Y3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Homer1Q9Z2Y3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Homer1Q9Z2Y3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Homer1Q9Z2Y3 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Homer1Q9Z2Y3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Homer1Q9Z2Y3 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Homer1Q9Z2Y3 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Homer1Q9Z2Y3 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Homer1Q9Z2Y3 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Homer1Q9Z2Y3 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Homer1Q9Z2Y3 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Homer1Q9Z2Y3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Homer1Q9Z2Y3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Homer1Q9Z2Y3 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Homer1Q9Z2Y3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Homer1Q9Z2Y3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Homer1Q9Z2Y3 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Homer1Q9Z2Y3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Homer1Q9Z2Y3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Homer1Q9Z2Y3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Homer1Q9Z2Y3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Homer1Q9Z2Y3 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Homer1Q9Z2Y3 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Homer1Q9Z2Y3 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Homer1Q9Z2Y3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Homer1Q9Z2Y3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Homer1Q9Z2Y3 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Homer1Q9Z2Y3 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Homer1Q9Z2Y3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Homer1Q9Z2Y3 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Homer1Q9Z2Y3 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Homer1Q9Z2Y3 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Homer1Q9Z2Y3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Homer1Q9Z2Y3 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Homer1Q9Z2Y3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Homer1Q9Z2Y3 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Homer1Q9Z2Y3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Homer1Q9Z2Y3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Homer1Q9Z2Y3 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Homer1Q9Z2Y3 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Homer1Q9Z2Y3 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Homer1Q9Z2Y3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Homer1Q9Z2Y3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Homer1Q9Z2Y3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Homer1Q9Z2Y3 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Homer1Q9Z2Y3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Homer1Q9Z2Y3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Homer1Q9Z2Y3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Homer1Q9Z2Y3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Homer1Q9Z2Y3 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Homer1Q9Z2Y3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Homer1Q9Z2Y3 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Homer1Q9Z2Y3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Homer1Q9Z2Y3 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Homer1Q9Z2Y3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Homer1Q9Z2Y3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Homer1Q9Z2Y3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Homer1Q9Z2Y3 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Homer1Q9Z2Y3 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Homer1Q9Z2Y3 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Homer1Q9Z2Y3 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Homer1Q9Z2Y3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Homer1Q9Z2Y3 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Homer1Q9Z2Y3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Homer1Q9Z2Y3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Homer1Q9Z2Y3 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Homer1Q9Z2Y3 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Homer1Q9Z2Y3 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Homer1Q9Z2Y3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Homer1Q9Z2Y3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Homer1Q9Z2Y3 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Homer1Q9Z2Y3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Homer1Q9Z2Y3 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Homer1Q9Z2Y3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Homer1Q9Z2Y3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Homer1Q9Z2Y3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Homer1Q9Z2Y3 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Homer1Q9Z2Y3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Homer1Q9Z2Y3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Homer1Q9Z2Y3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Homer1Q9Z2Y3 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Homer1Q9Z2Y3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Homer1Q9Z2Y3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Homer1Q9Z2Y3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Homer1Q9Z2Y3 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms