Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2L7

Crlf3, Cytokine receptor-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf3Q9Z2L7 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Crlf3Q9Z2L7 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Crlf3Q9Z2L7 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Crlf3Q9Z2L7 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Crlf3Q9Z2L7 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Crlf3Q9Z2L7 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Crlf3Q9Z2L7 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Crlf3Q9Z2L7 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Crlf3Q9Z2L7 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Crlf3Q9Z2L7 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Crlf3Q9Z2L7 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Crlf3Q9Z2L7 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Crlf3Q9Z2L7 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Crlf3Q9Z2L7 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Crlf3Q9Z2L7 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Crlf3Q9Z2L7 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Crlf3Q9Z2L7 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Crlf3Q9Z2L7 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Crlf3Q9Z2L7 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Crlf3Q9Z2L7 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Crlf3Q9Z2L7 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Crlf3Q9Z2L7 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Crlf3Q9Z2L7 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Crlf3Q9Z2L7 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Crlf3Q9Z2L7 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Crlf3Q9Z2L7 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Crlf3Q9Z2L7 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Crlf3Q9Z2L7 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Crlf3Q9Z2L7 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Crlf3Q9Z2L7 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Crlf3Q9Z2L7 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Crlf3Q9Z2L7 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Crlf3Q9Z2L7 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Crlf3Q9Z2L7 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Crlf3Q9Z2L7 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Crlf3Q9Z2L7 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Crlf3Q9Z2L7 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Crlf3Q9Z2L7 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Crlf3Q9Z2L7 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Crlf3Q9Z2L7 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Crlf3Q9Z2L7 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Crlf3Q9Z2L7 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Crlf3Q9Z2L7 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Crlf3Q9Z2L7 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Crlf3Q9Z2L7 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Crlf3Q9Z2L7 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Crlf3Q9Z2L7 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Crlf3Q9Z2L7 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Crlf3Q9Z2L7 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Crlf3Q9Z2L7 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Crlf3Q9Z2L7 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Crlf3Q9Z2L7 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Crlf3Q9Z2L7 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Crlf3Q9Z2L7 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Crlf3Q9Z2L7 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Crlf3Q9Z2L7 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Crlf3Q9Z2L7 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Crlf3Q9Z2L7 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Crlf3Q9Z2L7 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Crlf3Q9Z2L7 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Crlf3Q9Z2L7 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Crlf3Q9Z2L7 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Crlf3Q9Z2L7 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Crlf3Q9Z2L7 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Crlf3Q9Z2L7 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Crlf3Q9Z2L7 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Crlf3Q9Z2L7 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Crlf3Q9Z2L7 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Crlf3Q9Z2L7 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Crlf3Q9Z2L7 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Crlf3Q9Z2L7 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Crlf3Q9Z2L7 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Crlf3Q9Z2L7 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Crlf3Q9Z2L7 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Crlf3Q9Z2L7 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Crlf3Q9Z2L7 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Crlf3Q9Z2L7 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Crlf3Q9Z2L7 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Crlf3Q9Z2L7 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Crlf3Q9Z2L7 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Crlf3Q9Z2L7 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Crlf3Q9Z2L7 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Crlf3Q9Z2L7 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Crlf3Q9Z2L7 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Crlf3Q9Z2L7 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Crlf3Q9Z2L7 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Crlf3Q9Z2L7 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Crlf3Q9Z2L7 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Crlf3Q9Z2L7 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Crlf3Q9Z2L7 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Crlf3Q9Z2L7 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Crlf3Q9Z2L7 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Crlf3Q9Z2L7 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Crlf3Q9Z2L7 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Crlf3Q9Z2L7 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Crlf3Q9Z2L7 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Crlf3Q9Z2L7 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Crlf3Q9Z2L7 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Crlf3Q9Z2L7 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Crlf3Q9Z2L7 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 247.4 ms