Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2J6

Ptgdr2, Prostaglandin D2 receptor 2, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptgdr2Q9Z2J6 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ptgdr2Q9Z2J6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ptgdr2Q9Z2J6 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ptgdr2Q9Z2J6 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ptgdr2Q9Z2J6 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ptgdr2Q9Z2J6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ptgdr2Q9Z2J6 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ptgdr2Q9Z2J6 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ptgdr2Q9Z2J6 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ptgdr2Q9Z2J6 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ptgdr2Q9Z2J6 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ptgdr2Q9Z2J6 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ptgdr2Q9Z2J6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ptgdr2Q9Z2J6 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ptgdr2Q9Z2J6 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ptgdr2Q9Z2J6 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ptgdr2Q9Z2J6 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ptgdr2Q9Z2J6 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ptgdr2Q9Z2J6 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ptgdr2Q9Z2J6 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ptgdr2Q9Z2J6 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ptgdr2Q9Z2J6 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ptgdr2Q9Z2J6 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ptgdr2Q9Z2J6 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ptgdr2Q9Z2J6 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ptgdr2Q9Z2J6 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ptgdr2Q9Z2J6 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ptgdr2Q9Z2J6 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ptgdr2Q9Z2J6 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ptgdr2Q9Z2J6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ptgdr2Q9Z2J6 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ptgdr2Q9Z2J6 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ptgdr2Q9Z2J6 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ptgdr2Q9Z2J6 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ptgdr2Q9Z2J6 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ptgdr2Q9Z2J6 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ptgdr2Q9Z2J6 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ptgdr2Q9Z2J6 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ptgdr2Q9Z2J6 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ptgdr2Q9Z2J6 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ptgdr2Q9Z2J6 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ptgdr2Q9Z2J6 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ptgdr2Q9Z2J6 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ptgdr2Q9Z2J6 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ptgdr2Q9Z2J6 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ptgdr2Q9Z2J6 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ptgdr2Q9Z2J6 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ptgdr2Q9Z2J6 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ptgdr2Q9Z2J6 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ptgdr2Q9Z2J6 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ptgdr2Q9Z2J6 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ptgdr2Q9Z2J6 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ptgdr2Q9Z2J6 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ptgdr2Q9Z2J6 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ptgdr2Q9Z2J6 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ptgdr2Q9Z2J6 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ptgdr2Q9Z2J6 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ptgdr2Q9Z2J6 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ptgdr2Q9Z2J6 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ptgdr2Q9Z2J6 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ptgdr2Q9Z2J6 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ptgdr2Q9Z2J6 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ptgdr2Q9Z2J6 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ptgdr2Q9Z2J6 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ptgdr2Q9Z2J6 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ptgdr2Q9Z2J6 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ptgdr2Q9Z2J6 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ptgdr2Q9Z2J6 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ptgdr2Q9Z2J6 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ptgdr2Q9Z2J6 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ptgdr2Q9Z2J6 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ptgdr2Q9Z2J6 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ptgdr2Q9Z2J6 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ptgdr2Q9Z2J6 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ptgdr2Q9Z2J6 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ptgdr2Q9Z2J6 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ptgdr2Q9Z2J6 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ptgdr2Q9Z2J6 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ptgdr2Q9Z2J6 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ptgdr2Q9Z2J6 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ptgdr2Q9Z2J6 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ptgdr2Q9Z2J6 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ptgdr2Q9Z2J6 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ptgdr2Q9Z2J6 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ptgdr2Q9Z2J6 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ptgdr2Q9Z2J6 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ptgdr2Q9Z2J6 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ptgdr2Q9Z2J6 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ptgdr2Q9Z2J6 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ptgdr2Q9Z2J6 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ptgdr2Q9Z2J6 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ptgdr2Q9Z2J6 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ptgdr2Q9Z2J6 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms