Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Mbd3Q9Z2D8 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Mbd3Q9Z2D8 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Mbd3Q9Z2D8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Mbd3Q9Z2D8 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Mbd3Q9Z2D8 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Mbd3Q9Z2D8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Mbd3Q9Z2D8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Mbd3Q9Z2D8 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Mbd3Q9Z2D8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Mbd3Q9Z2D8 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Mbd3Q9Z2D8 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Mbd3Q9Z2D8 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Mbd3Q9Z2D8 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Mbd3Q9Z2D8 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Mbd3Q9Z2D8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Mbd3Q9Z2D8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Mbd3Q9Z2D8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Mbd3Q9Z2D8 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Mbd3Q9Z2D8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Mbd3Q9Z2D8 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Mbd3Q9Z2D8 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Mbd3Q9Z2D8 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Mbd3Q9Z2D8 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Mbd3Q9Z2D8 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Mbd3Q9Z2D8 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Mbd3Q9Z2D8 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Mbd3Q9Z2D8 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Mbd3Q9Z2D8 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Mbd3Q9Z2D8 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Mbd3Q9Z2D8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Mbd3Q9Z2D8 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Mbd3Q9Z2D8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Mbd3Q9Z2D8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Mbd3Q9Z2D8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Mbd3Q9Z2D8 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Mbd3Q9Z2D8 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Mbd3Q9Z2D8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Mbd3Q9Z2D8 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Mbd3Q9Z2D8 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Mbd3Q9Z2D8 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Mbd3Q9Z2D8 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Mbd3Q9Z2D8 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Mbd3Q9Z2D8 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Mbd3Q9Z2D8 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Mbd3Q9Z2D8 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Mbd3Q9Z2D8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Mbd3Q9Z2D8 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Mbd3Q9Z2D8 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Mbd3Q9Z2D8 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Mbd3Q9Z2D8 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Mbd3Q9Z2D8 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Mbd3Q9Z2D8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Mbd3Q9Z2D8 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Mbd3Q9Z2D8 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Mbd3Q9Z2D8 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Mbd3Q9Z2D8 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Mbd3Q9Z2D8 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Mbd3Q9Z2D8 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Mbd3Q9Z2D8 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Mbd3Q9Z2D8 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Mbd3Q9Z2D8 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Mbd3Q9Z2D8 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Mbd3Q9Z2D8 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Mbd3Q9Z2D8 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Mbd3Q9Z2D8 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Mbd3Q9Z2D8 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Mbd3Q9Z2D8 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Mbd3Q9Z2D8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Mbd3Q9Z2D8 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Mbd3Q9Z2D8 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Mbd3Q9Z2D8 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Mbd3Q9Z2D8 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Mbd3Q9Z2D8 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Mbd3Q9Z2D8 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Mbd3Q9Z2D8 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Mbd3Q9Z2D8 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Mbd3Q9Z2D8 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Mbd3Q9Z2D8 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Mbd3Q9Z2D8 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Mbd3Q9Z2D8 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Mbd3Q9Z2D8 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Mbd3Q9Z2D8 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Mbd3Q9Z2D8 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Mbd3Q9Z2D8 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Mbd3Q9Z2D8 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Mbd3Q9Z2D8 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Mbd3Q9Z2D8 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Mbd3Q9Z2D8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Mbd3Q9Z2D8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Mbd3Q9Z2D8 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Mbd3Q9Z2D8 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Mbd3Q9Z2D8 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Mbd3Q9Z2D8 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Mbd3Q9Z2D8 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Mbd3Q9Z2D8 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Mbd3Q9Z2D8 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Mbd3Q9Z2D8 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Mbd3Q9Z2D8 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Mbd3Q9Z2D8 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms