Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z273

Tulp1, Tubby-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tulp1Q9Z273 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tulp1Q9Z273 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tulp1Q9Z273 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tulp1Q9Z273 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tulp1Q9Z273 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tulp1Q9Z273 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tulp1Q9Z273 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Tulp1Q9Z273 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tulp1Q9Z273 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tulp1Q9Z273 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tulp1Q9Z273 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tulp1Q9Z273 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tulp1Q9Z273 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tulp1Q9Z273 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tulp1Q9Z273 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tulp1Q9Z273 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tulp1Q9Z273 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tulp1Q9Z273 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tulp1Q9Z273 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tulp1Q9Z273 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tulp1Q9Z273 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tulp1Q9Z273 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Tulp1Q9Z273 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tulp1Q9Z273 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tulp1Q9Z273 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tulp1Q9Z273 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tulp1Q9Z273 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tulp1Q9Z273 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tulp1Q9Z273 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tulp1Q9Z273 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tulp1Q9Z273 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tulp1Q9Z273 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tulp1Q9Z273 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tulp1Q9Z273 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tulp1Q9Z273 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tulp1Q9Z273 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tulp1Q9Z273 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tulp1Q9Z273 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tulp1Q9Z273 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tulp1Q9Z273 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Tulp1Q9Z273 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tulp1Q9Z273 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tulp1Q9Z273 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tulp1Q9Z273 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Tulp1Q9Z273 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tulp1Q9Z273 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Tulp1Q9Z273 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Tulp1Q9Z273 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Tulp1Q9Z273 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tulp1Q9Z273 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tulp1Q9Z273 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tulp1Q9Z273 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tulp1Q9Z273 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tulp1Q9Z273 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tulp1Q9Z273 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tulp1Q9Z273 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tulp1Q9Z273 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tulp1Q9Z273 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tulp1Q9Z273 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tulp1Q9Z273 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tulp1Q9Z273 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tulp1Q9Z273 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tulp1Q9Z273 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tulp1Q9Z273 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tulp1Q9Z273 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tulp1Q9Z273 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tulp1Q9Z273 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Tulp1Q9Z273 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tulp1Q9Z273 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tulp1Q9Z273 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tulp1Q9Z273 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Tulp1Q9Z273 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tulp1Q9Z273 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tulp1Q9Z273 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tulp1Q9Z273 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tulp1Q9Z273 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tulp1Q9Z273 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tulp1Q9Z273 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tulp1Q9Z273 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tulp1Q9Z273 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Tulp1Q9Z273 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tulp1Q9Z273 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tulp1Q9Z273 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tulp1Q9Z273 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Tulp1Q9Z273 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tulp1Q9Z273 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tulp1Q9Z273 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tulp1Q9Z273 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tulp1Q9Z273 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tulp1Q9Z273 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tulp1Q9Z273 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tulp1Q9Z273 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tulp1Q9Z273 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tulp1Q9Z273 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tulp1Q9Z273 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tulp1Q9Z273 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tulp1Q9Z273 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tulp1Q9Z273 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tulp1Q9Z273 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tulp1Q9Z273 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms