Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N7

Arid3b, AT-rich interactive domain-containing protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arid3bQ9Z1N7 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Arid3bQ9Z1N7 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Arid3bQ9Z1N7 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Arid3bQ9Z1N7 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Arid3bQ9Z1N7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Arid3bQ9Z1N7 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Arid3bQ9Z1N7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Arid3bQ9Z1N7 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Arid3bQ9Z1N7 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Arid3bQ9Z1N7 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Arid3bQ9Z1N7 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Arid3bQ9Z1N7 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Arid3bQ9Z1N7 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Arid3bQ9Z1N7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Arid3bQ9Z1N7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Arid3bQ9Z1N7 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Arid3bQ9Z1N7 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Arid3bQ9Z1N7 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Arid3bQ9Z1N7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Arid3bQ9Z1N7 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Arid3bQ9Z1N7 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Arid3bQ9Z1N7 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Arid3bQ9Z1N7 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Arid3bQ9Z1N7 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Arid3bQ9Z1N7 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Arid3bQ9Z1N7 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Arid3bQ9Z1N7 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Arid3bQ9Z1N7 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Arid3bQ9Z1N7 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Arid3bQ9Z1N7 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Arid3bQ9Z1N7 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Arid3bQ9Z1N7 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Arid3bQ9Z1N7 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Arid3bQ9Z1N7 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Arid3bQ9Z1N7 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Arid3bQ9Z1N7 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Arid3bQ9Z1N7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Arid3bQ9Z1N7 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Arid3bQ9Z1N7 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Arid3bQ9Z1N7 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Arid3bQ9Z1N7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Arid3bQ9Z1N7 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Arid3bQ9Z1N7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Arid3bQ9Z1N7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Arid3bQ9Z1N7 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Arid3bQ9Z1N7 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Arid3bQ9Z1N7 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Arid3bQ9Z1N7 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Arid3bQ9Z1N7 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Arid3bQ9Z1N7 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Arid3bQ9Z1N7 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Arid3bQ9Z1N7 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Arid3bQ9Z1N7 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Arid3bQ9Z1N7 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Arid3bQ9Z1N7 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Arid3bQ9Z1N7 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Arid3bQ9Z1N7 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Arid3bQ9Z1N7 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Arid3bQ9Z1N7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Arid3bQ9Z1N7 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Arid3bQ9Z1N7 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Arid3bQ9Z1N7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Arid3bQ9Z1N7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Arid3bQ9Z1N7 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Arid3bQ9Z1N7 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Arid3bQ9Z1N7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Arid3bQ9Z1N7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Arid3bQ9Z1N7 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Arid3bQ9Z1N7 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Arid3bQ9Z1N7 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Arid3bQ9Z1N7 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Arid3bQ9Z1N7 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Arid3bQ9Z1N7 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Arid3bQ9Z1N7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Arid3bQ9Z1N7 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Arid3bQ9Z1N7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Arid3bQ9Z1N7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Arid3bQ9Z1N7 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Arid3bQ9Z1N7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Arid3bQ9Z1N7 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Arid3bQ9Z1N7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Arid3bQ9Z1N7 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Arid3bQ9Z1N7 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Arid3bQ9Z1N7 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Arid3bQ9Z1N7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Arid3bQ9Z1N7 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Arid3bQ9Z1N7 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Arid3bQ9Z1N7 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Arid3bQ9Z1N7 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Arid3bQ9Z1N7 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Arid3bQ9Z1N7 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Arid3bQ9Z1N7 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Arid3bQ9Z1N7 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Arid3bQ9Z1N7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Arid3bQ9Z1N7 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Arid3bQ9Z1N7 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Arid3bQ9Z1N7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Arid3bQ9Z1N7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Arid3bQ9Z1N7 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Arid3bQ9Z1N7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms