Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L4

Rs1, Retinoschisin, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rs1Q9Z1L4 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rs1Q9Z1L4 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rs1Q9Z1L4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rs1Q9Z1L4 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rs1Q9Z1L4 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rs1Q9Z1L4 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rs1Q9Z1L4 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rs1Q9Z1L4 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rs1Q9Z1L4 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rs1Q9Z1L4 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rs1Q9Z1L4 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rs1Q9Z1L4 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rs1Q9Z1L4 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rs1Q9Z1L4 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rs1Q9Z1L4 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rs1Q9Z1L4 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rs1Q9Z1L4 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rs1Q9Z1L4 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rs1Q9Z1L4 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rs1Q9Z1L4 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rs1Q9Z1L4 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rs1Q9Z1L4 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rs1Q9Z1L4 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rs1Q9Z1L4 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rs1Q9Z1L4 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rs1Q9Z1L4 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rs1Q9Z1L4 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rs1Q9Z1L4 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rs1Q9Z1L4 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rs1Q9Z1L4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rs1Q9Z1L4 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rs1Q9Z1L4 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rs1Q9Z1L4 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rs1Q9Z1L4 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rs1Q9Z1L4 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rs1Q9Z1L4 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rs1Q9Z1L4 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rs1Q9Z1L4 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rs1Q9Z1L4 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rs1Q9Z1L4 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rs1Q9Z1L4 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rs1Q9Z1L4 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rs1Q9Z1L4 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rs1Q9Z1L4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rs1Q9Z1L4 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rs1Q9Z1L4 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rs1Q9Z1L4 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rs1Q9Z1L4 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rs1Q9Z1L4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rs1Q9Z1L4 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rs1Q9Z1L4 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rs1Q9Z1L4 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rs1Q9Z1L4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rs1Q9Z1L4 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rs1Q9Z1L4 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rs1Q9Z1L4 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rs1Q9Z1L4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rs1Q9Z1L4 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rs1Q9Z1L4 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rs1Q9Z1L4 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rs1Q9Z1L4 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rs1Q9Z1L4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rs1Q9Z1L4 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rs1Q9Z1L4 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rs1Q9Z1L4 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rs1Q9Z1L4 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rs1Q9Z1L4 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rs1Q9Z1L4 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rs1Q9Z1L4 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rs1Q9Z1L4 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rs1Q9Z1L4 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rs1Q9Z1L4 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rs1Q9Z1L4 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rs1Q9Z1L4 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rs1Q9Z1L4 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rs1Q9Z1L4 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rs1Q9Z1L4 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rs1Q9Z1L4 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rs1Q9Z1L4 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rs1Q9Z1L4 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rs1Q9Z1L4 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rs1Q9Z1L4 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rs1Q9Z1L4 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rs1Q9Z1L4 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rs1Q9Z1L4 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rs1Q9Z1L4 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rs1Q9Z1L4 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rs1Q9Z1L4 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rs1Q9Z1L4 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rs1Q9Z1L4 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rs1Q9Z1L4 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rs1Q9Z1L4 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rs1Q9Z1L4 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rs1Q9Z1L4 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rs1Q9Z1L4 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rs1Q9Z1L4 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rs1Q9Z1L4 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rs1Q9Z1L4 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rs1Q9Z1L4 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rs1Q9Z1L4 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms