Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z125

Creb3l1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Creb3l1Q9Z125 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Creb3l1Q9Z125 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Creb3l1Q9Z125 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Creb3l1Q9Z125 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Creb3l1Q9Z125 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Creb3l1Q9Z125 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Creb3l1Q9Z125 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Creb3l1Q9Z125 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Creb3l1Q9Z125 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Creb3l1Q9Z125 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Creb3l1Q9Z125 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Creb3l1Q9Z125 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Creb3l1Q9Z125 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Creb3l1Q9Z125 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Creb3l1Q9Z125 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Creb3l1Q9Z125 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Creb3l1Q9Z125 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Creb3l1Q9Z125 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Creb3l1Q9Z125 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Creb3l1Q9Z125 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Creb3l1Q9Z125 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Creb3l1Q9Z125 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Creb3l1Q9Z125 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Creb3l1Q9Z125 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Creb3l1Q9Z125 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Creb3l1Q9Z125 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Creb3l1Q9Z125 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Creb3l1Q9Z125 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Creb3l1Q9Z125 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Creb3l1Q9Z125 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Creb3l1Q9Z125 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Creb3l1Q9Z125 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Creb3l1Q9Z125 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Creb3l1Q9Z125 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Creb3l1Q9Z125 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Creb3l1Q9Z125 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Creb3l1Q9Z125 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Creb3l1Q9Z125 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Creb3l1Q9Z125 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Creb3l1Q9Z125 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Creb3l1Q9Z125 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Creb3l1Q9Z125 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Creb3l1Q9Z125 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Creb3l1Q9Z125 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Creb3l1Q9Z125 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Creb3l1Q9Z125 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Creb3l1Q9Z125 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Creb3l1Q9Z125 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Creb3l1Q9Z125 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Creb3l1Q9Z125 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Creb3l1Q9Z125 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Creb3l1Q9Z125 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Creb3l1Q9Z125 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Creb3l1Q9Z125 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Creb3l1Q9Z125 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Creb3l1Q9Z125 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Creb3l1Q9Z125 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Creb3l1Q9Z125 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Creb3l1Q9Z125 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Creb3l1Q9Z125 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Creb3l1Q9Z125 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Creb3l1Q9Z125 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Creb3l1Q9Z125 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Creb3l1Q9Z125 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Creb3l1Q9Z125 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Creb3l1Q9Z125 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Creb3l1Q9Z125 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Creb3l1Q9Z125 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Creb3l1Q9Z125 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Creb3l1Q9Z125 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Creb3l1Q9Z125 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Creb3l1Q9Z125 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Creb3l1Q9Z125 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Creb3l1Q9Z125 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Creb3l1Q9Z125 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Creb3l1Q9Z125 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Creb3l1Q9Z125 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Creb3l1Q9Z125 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Creb3l1Q9Z125 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Creb3l1Q9Z125 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Creb3l1Q9Z125 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Creb3l1Q9Z125 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Creb3l1Q9Z125 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Creb3l1Q9Z125 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Creb3l1Q9Z125 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Creb3l1Q9Z125 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Creb3l1Q9Z125 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Creb3l1Q9Z125 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Creb3l1Q9Z125 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Creb3l1Q9Z125 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Creb3l1Q9Z125 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Creb3l1Q9Z125 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Creb3l1Q9Z125 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Creb3l1Q9Z125 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Creb3l1Q9Z125 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Creb3l1Q9Z125 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Creb3l1Q9Z125 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Creb3l1Q9Z125 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Creb3l1Q9Z125 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Creb3l1Q9Z125 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms