Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0I7

Slfn1, Schlafen 1, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn1Q9Z0I7 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Slfn1Q9Z0I7 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Slfn1Q9Z0I7 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Slfn1Q9Z0I7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Slfn1Q9Z0I7 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Slfn1Q9Z0I7 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Slfn1Q9Z0I7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Slfn1Q9Z0I7 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Slfn1Q9Z0I7 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Slfn1Q9Z0I7 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Slfn1Q9Z0I7 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Slfn1Q9Z0I7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Slfn1Q9Z0I7 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Slfn1Q9Z0I7 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Slfn1Q9Z0I7 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Slfn1Q9Z0I7 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Slfn1Q9Z0I7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Slfn1Q9Z0I7 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Slfn1Q9Z0I7 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Slfn1Q9Z0I7 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Slfn1Q9Z0I7 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Slfn1Q9Z0I7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Slfn1Q9Z0I7 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Slfn1Q9Z0I7 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Slfn1Q9Z0I7 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Slfn1Q9Z0I7 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Slfn1Q9Z0I7 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Slfn1Q9Z0I7 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Slfn1Q9Z0I7 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Slfn1Q9Z0I7 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Slfn1Q9Z0I7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Slfn1Q9Z0I7 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Slfn1Q9Z0I7 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Slfn1Q9Z0I7 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Slfn1Q9Z0I7 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Slfn1Q9Z0I7 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Slfn1Q9Z0I7 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Slfn1Q9Z0I7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Slfn1Q9Z0I7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Slfn1Q9Z0I7 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Slfn1Q9Z0I7 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Slfn1Q9Z0I7 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Slfn1Q9Z0I7 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Slfn1Q9Z0I7 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Slfn1Q9Z0I7 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Slfn1Q9Z0I7 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Slfn1Q9Z0I7 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Slfn1Q9Z0I7 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Slfn1Q9Z0I7 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Slfn1Q9Z0I7 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Slfn1Q9Z0I7 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Slfn1Q9Z0I7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Slfn1Q9Z0I7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Slfn1Q9Z0I7 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Slfn1Q9Z0I7 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Slfn1Q9Z0I7 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Slfn1Q9Z0I7 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Slfn1Q9Z0I7 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Slfn1Q9Z0I7 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Slfn1Q9Z0I7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Slfn1Q9Z0I7 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Slfn1Q9Z0I7 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Slfn1Q9Z0I7 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Slfn1Q9Z0I7 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Slfn1Q9Z0I7 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Slfn1Q9Z0I7 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Slfn1Q9Z0I7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Slfn1Q9Z0I7 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Slfn1Q9Z0I7 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Slfn1Q9Z0I7 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Slfn1Q9Z0I7 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Slfn1Q9Z0I7 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Slfn1Q9Z0I7 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Slfn1Q9Z0I7 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Slfn1Q9Z0I7 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Slfn1Q9Z0I7 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Slfn1Q9Z0I7 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Slfn1Q9Z0I7 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Slfn1Q9Z0I7 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Slfn1Q9Z0I7 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Slfn1Q9Z0I7 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Slfn1Q9Z0I7 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Slfn1Q9Z0I7 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Slfn1Q9Z0I7 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Slfn1Q9Z0I7 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Slfn1Q9Z0I7 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Slfn1Q9Z0I7 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Slfn1Q9Z0I7 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Slfn1Q9Z0I7 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Slfn1Q9Z0I7 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Slfn1Q9Z0I7 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Slfn1Q9Z0I7 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Slfn1Q9Z0I7 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Slfn1Q9Z0I7 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Slfn1Q9Z0I7 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slfn1Q9Z0I7 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slfn1Q9Z0I7 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slfn1Q9Z0I7 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Slfn1Q9Z0I7 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Slfn1Q9Z0I7 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms